混沌守护者离去后的百年间，林羽等人于星辉城废墟上重建“混元圣城”，以混沌秘钥之力为根基，构筑起笼罩整片星域的防御结界。城中修炼者往来如织，混沌法则的感悟之声与兵器交鸣此起彼伏，却不知一场裹挟着上古秘辛的危机正从宇宙边缘悄然蔓延。
某日，洛璃正在圣城中央的净化塔中闭关，其眉心的净化符文突然迸发刺目金光，映出一幅幅破碎的画面：幽暗深邃的暗域中，无数黑袍人围绕着一座布满裂痕的青铜古棺起舞，棺椁缝隙渗出的漆黑液体竟在空中凝成锁链，将整片星域缠绕成囚笼。洛璃猛然睁开双眼，净化之力不受控制地暴涨，塔身剧烈震颤，惊动了正在混沌试炼场修炼的林羽。
“林羽！我感知到暗域方向有股熟悉的邪恶气息，与黑袍人、血渊都有关联！”洛璃通过神识急切传音。林羽手中的混沌战戟瞬间撕裂空间，出现在净化塔顶，他凝视着西北方的虚空，那里的星辰排列竟隐隐组成一道封印阵法的轮廓，“这是...上古圣墟的方位！混沌祖神残魂曾说，圣墟镇压着能颠覆宇宙的‘灾厄之源’。”
二人立即召集敖夜、凤凰族长与混元圣城的长老议事。大殿中，凤凰族长展开一卷布满焦痕的古老星图，其上用赤色朱砂标注的暗域坐标正在渗出黑雾：“三百年前，我族古籍记载的最后一次圣墟异动，与如今暗域的能量波动频率完全一致。更诡异的是，星图显示圣墟核心存在九道与混沌秘钥同源的气息。”
敖夜龙尾重重一拍地面，震得殿内符文闪烁：“定是黑袍势力在圣墟搞鬼！他们既能唤醒血渊之主，难保不会对‘灾厄之源’下手！”林羽沉思片刻，取出怀中的混沌秘钥碎片，碎片表面的纹路竟开始扭曲延伸，在空中勾勒出通往暗域的空间裂缝：“秘钥有感应，说明我们必须立刻出发。但此行凶险，留守圣城的长老务必加强结界防御。”
踏入暗域的刹那，众人仿佛坠入凝固的墨汁。这里没有星辰，没有时间流动，唯有远处传来的铁链拖拽声在虚空中回荡。林羽运转混沌之力形成光盾，却见盾面不断浮现诡异的蚀痕，仿佛有无数细小的牙齿在啃噬。“小心！这里的暗物质能侵蚀法则之力！”他话音未落，一道黑影突然从脚下窜出，直取洛璃咽喉。
敖夜龙爪横空一抓，将黑影捏在掌心，却见那是团由怨念凝聚的人形黑雾，黑雾中隐约透出黑袍人的轮廓。“是黑袍势力的探路傀儡！”洛璃指尖点出净化之光，黑雾在光芒中发出刺耳尖啸，消散前竟传出一段冷笑：“来得正好，圣墟的祭品，一个都别想逃！”
继续深入，一座由巨大骸骨搭建的桥梁横跨在沸腾的暗河之上。每根骸骨都刻满古老诅咒，当林羽等人踏上桥梁，骸骨空洞的眼窝突然亮起幽绿光芒，无数骷髅士兵从暗河中爬出。这些士兵手中的骨刃蕴含着腐蚀灵魂的力量，凤凰族长的火焰羽翼扫过，竟被瞬间冻结。
“它们的弱点在眉心！”林羽混沌战戟划出半月形光芒，戟刃触及骷髅眉心的刹那，秘钥碎片突然发出共鸣，光芒所过之处，骷髅士兵尽数化为齑粉。然而，更多的骷髅从四面八方涌来，将众人围困在桥中央。敖夜怒吼着喷出龙息，却见龙息在接触骷髅群的瞬间，被转化为黑色毒雾反袭而来。
千钧一发之际，林羽将混沌战戟插入地面，调动秘钥之力形成防护罩。他的本源核心剧烈跳动，识海中浮现出混沌战典的残缺篇章——“混沌噬灵诀”。尝试运转功法，防护罩竟开始吞噬周围的暗物质与骷髅怨念，化作一道道金色锁链缠绕在战戟之上。“原来如此！以恶制恶！”林羽挥动战戟，金色锁链如灵蛇般穿梭，将骷髅群绞成虚无。
冲破骷髅阵后，众人终于抵达圣墟外围。一座高耸入云的青铜巨门矗立眼前，门上镌刻的混沌符文正在黯淡熄灭，取而代之的是密密麻麻的黑色咒文。凤凰族长突然指着门侧的断碑惊呼：“这碑文记载的是上古混沌之战！当年十二位混沌至尊以自身为祭品，才将‘灾厄之源’封印于此，而开启封印的关键...竟是九块混沌秘钥！”
话音未落，巨门轰然洞开，一股比血渊更恐怖的威压扑面而来。门内，黑袍势力的首领现身，他头戴镶嵌九颗黑色晶体的王冠，周身缠绕着由无数修士残魂组成的披风。“来得太慢了，林羽。”首领的声音像是从九幽深渊传来，“圣墟的‘灾厄之源’，需要九钥之力才能彻底解封，而你，就是最后一块拼图。”
首领抬手间，王冠上的黑色晶体同时亮起，圣墟深处传来锁链崩断的轰鸣。林羽等人只觉识海剧痛，混沌秘钥碎片竟不受控制地飞向首领。千钧一发之际，林羽咬破舌尖，以精血为引强行召回秘钥，却见秘钥表面浮现出与王冠晶体相同的纹路。“不好！秘钥被下了禁制！”
首领放声大笑，身后的空间裂开无数缝隙，从中走出八名气息丝毫不弱于混沌暗尊的黑袍强者。他们手中各自握着散发着诡异光芒的法器，法器造型竟与圣墟外围的骸骨如出一辙。“这是上古混沌至尊的残躯炼制的‘灭世凶兵’！”混沌祖神的残魂在林羽识海中惊呼，“当年封印‘灾厄之源’后，他们的尸骸被黑袍势力窃取！”
战斗瞬间爆发。敖夜迎战三名黑袍强者，龙鳞在凶兵的攻击下迸溅火星；洛璃与凤凰族长联手对抗首领，净化之力与凤凰火焰却被王冠的黑色光芒尽数吞噬；林羽独自面对五名强敌，混沌战戟与灭世凶兵相撞，每一次交锋都震得他虎口发麻。更可怕的是，随着战斗持续，圣墟深处的威压越来越强，似乎有某种存在即将苏醒。
危机时刻，林羽突然想起混沌守护者传授的秘法——“混沌共鸣·逆元阵”。他强忍着剧痛，将自身与敖夜、洛璃、凤凰族长的力量通过秘钥相连，四人的本源核心在空中组成逆转时空的阵图。阵图光芒所及之处，黑袍强者的攻击竟开始回溯消散，而他们手中的灭世凶兵，也显露出被封印前的圣洁模样。
“雕虫小技！”首领暴喝一声，王冠上的黑色晶体全部碎裂，化作漫天黑雨。黑雨落地生根，竟长成一片吞噬光线的荆棘森林，荆棘尖端滴落的毒液，连混沌法则都能腐蚀。林羽等人被困在荆棘阵中，力量消耗速度急剧加快。
就在众人濒临绝境时，圣墟深处传来一声响彻宇宙的咆哮。地面裂开巨大缝隙，一只遮天蔽日的巨手从中伸出，巨手皮肤布满肉瘤，每一个肉瘤中都封印着一个扭曲的面孔。“灾厄之源...要苏醒了！”混沌祖神的残魂声音颤抖，“它是混沌初开时的负面意志具现，一旦完全复苏，宇宙将重归虚无！”
首领望着巨手，脸上露出癫狂的笑容：“看到了吗？这才是真正的力量！林羽，交出秘钥，我可留你全尸！”林羽握紧混沌战戟，目光坚定：“想要秘钥，先从我尸体上踏过去！”他将全部力量注入秘钥，九块碎片在空中组成一个巨大的罗盘，罗盘指针竟开始逆向旋转——这是逆转因果的禁忌之术！
然而，就在罗盘即将成型之际，荆棘阵突然收缩，一根毒刺贯穿林羽的左肩。鲜血滴落的瞬间，秘钥光芒骤暗，灾厄之源的巨手离众人更近一步。千钧一发之际，混元圣城方向传来一道璀璨光芒，竟是留守的长老们燃烧本源，通过秘钥与林羽建立共鸣。
“林羽！我们助你！”长老们的声音在虚空中回荡。林羽眼中闪过决然之色，他将自身本源与众人力量完全融合，混沌秘钥爆发出创世神的威严光芒。光芒中，九块碎片化作九把钥匙，插入灾厄之源巨手上的九道伤口。
“给我...封印！”林羽怒吼。九把钥匙同时转动，灾厄之源发出震天动地的哀嚎，巨手开始崩解。黑袍首领见状，试图抢夺秘钥，却被敖夜、洛璃和凤凰族长联手拦下。最终，在混沌之力与众人的信念下，灾厄之源被重新封印，黑袍势力的强者们也在光芒中灰飞烟灭。
战斗结束，圣墟开始崩塌。林羽等人拼尽全力逃出暗域，却见混元圣城方向升起滚滚浓烟。原来在他们战斗时，黑袍势力的残余力量偷袭了圣城。“走！回圣城！”林羽握紧拳头，混沌战戟上的光芒愈发炽烈。这场与邪恶势力的较量，远未到结束的时候...... 而在宇宙深处，那个神秘的种子已悄然破土，一株散发着诡异气息的古树正在黑暗中生长，它的每一片叶子，都映照着某个星域的覆灭......